De taxonomía discutida, el Citrus x microcarpa se cree originario del sudeste asiático, y más concretamente de Filipinas donde se utiliza en diversos platos de la gastronomía tradicional; aunque su presencia en China parece también muy antigua y se usa con frecuencia en el arte del bonsái. El epíteto Citrus en griego significa limón, mientras que microcarpa deriva de los términos griegos mikrós (pequeño) y karpós (fruto), en alusión a sus pequeños frutos. El nombre común calamondín deriva precisamente del tagalog kalamansi.

La taxonomía del género Citrus es compleja, y la ubicación taxonómica de esta especie ha sido muy discutida, aunque actualmente se acepta que son un cítrico más. Muchos autores lo englobaban en el género x Citrofortunella, híbrido de Citrus reticulata y el kumquat, especie que hasta hace poco estaba en su propio género, (Fortunella), pero que tras los últimos estudios genéticos ha pasado a denominarse Citrus japonica); lo que arrastra a este híbrido al mismo género. El calamondín también ha recibido la denominación Citrus mitis ('sin espinas'), C. madurensis (de Madura, isla de Java),

Sus pequeñas naranjas son comestibles, agrias, y se utilizan de forma similar a limones o limas, aunque no es raro que se utiliza con fines meramente ornamentales. Se desarrolla sin problemas en maceta, aunque puede superar sin problemas los 2 o 3 metros de altura.